Protein–RNA interactions for Protein: Q00994

BEX3, Protein BEX3, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEX3Q00994 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms