Protein–RNA interactions for Protein: P82251

SLC7A9, b(0,+)-type amino acid transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC7A9P82251 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC7A9P82251 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC7A9P82251 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC7A9P82251 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC7A9P82251 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC7A9P82251 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC7A9P82251 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC7A9P82251 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC7A9P82251 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC7A9P82251 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC7A9P82251 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC7A9P82251 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC7A9P82251 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC7A9P82251 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SLC7A9P82251 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC7A9P82251 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SLC7A9P82251 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SLC7A9P82251 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC7A9P82251 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC7A9P82251 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC7A9P82251 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC7A9P82251 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC7A9P82251 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC7A9P82251 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SLC7A9P82251 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC7A9P82251 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC7A9P82251 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC7A9P82251 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC7A9P82251 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC7A9P82251 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC7A9P82251 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC7A9P82251 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC7A9P82251 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC7A9P82251 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC7A9P82251 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SLC7A9P82251 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC7A9P82251 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC7A9P82251 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC7A9P82251 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC7A9P82251 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC7A9P82251 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC7A9P82251 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC7A9P82251 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC7A9P82251 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC7A9P82251 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SLC7A9P82251 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SLC7A9P82251 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC7A9P82251 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC7A9P82251 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SLC7A9P82251 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC7A9P82251 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC7A9P82251 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SLC7A9P82251 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC7A9P82251 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC7A9P82251 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC7A9P82251 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC7A9P82251 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC7A9P82251 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC7A9P82251 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC7A9P82251 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC7A9P82251 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC7A9P82251 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC7A9P82251 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC7A9P82251 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC7A9P82251 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC7A9P82251 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC7A9P82251 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC7A9P82251 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC7A9P82251 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC7A9P82251 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC7A9P82251 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC7A9P82251 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SLC7A9P82251 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SLC7A9P82251 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SLC7A9P82251 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SLC7A9P82251 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SLC7A9P82251 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SLC7A9P82251 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SLC7A9P82251 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SLC7A9P82251 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SLC7A9P82251 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SLC7A9P82251 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.05■□□□□ 0
SLC7A9P82251 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SLC7A9P82251 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SLC7A9P82251 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SLC7A9P82251 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC7A9P82251 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC7A9P82251 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC7A9P82251 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC7A9P82251 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SLC7A9P82251 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC7A9P82251 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC7A9P82251 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC7A9P82251 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC7A9P82251 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC7A9P82251 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC7A9P82251 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC7A9P82251 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC7A9P82251 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC7A9P82251 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.5 ms