Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HBBP68871 NFKBIZ-202ENST00000326172 3923 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HBBP68871 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HBBP68871 PTPRK-204ENST00000368210 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HBBP68871 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HBBP68871 TRPM2-201ENST00000300481 5627 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HBBP68871 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HBBP68871 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HBBP68871 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HBBP68871 UNC13D-201ENST00000207549 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HBBP68871 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HBBP68871 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HBBP68871 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HBBP68871 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HBBP68871 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HBBP68871 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HBBP68871 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HBBP68871 COL18A1-AS1-201ENST00000397787 3425 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HBBP68871 RRBP1-201ENST00000246043 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HBBP68871 WDR73-202ENST00000434634 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HBBP68871 HPS3-201ENST00000296051 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HBBP68871 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HBBP68871 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HBBP68871 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HBBP68871 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HBBP68871 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HBBP68871 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HBBP68871 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HBBP68871 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HBBP68871 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HBBP68871 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HBBP68871 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HBBP68871 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HBBP68871 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HBBP68871 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HBBP68871 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HBBP68871 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HBBP68871 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HBBP68871 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HBBP68871 SH3PXD2A-203ENST00000369774 11468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HBBP68871 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HBBP68871 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HBBP68871 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HBBP68871 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HBBP68871 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HBBP68871 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
HBBP68871 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HBBP68871 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HBBP68871 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HBBP68871 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HBBP68871 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HBBP68871 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HBBP68871 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HBBP68871 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HBBP68871 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HBBP68871 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HBBP68871 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HBBP68871 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HBBP68871 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HBBP68871 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HBBP68871 ROBO1-201ENST00000436010 7501 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HBBP68871 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HBBP68871 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HBBP68871 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HBBP68871 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HBBP68871 TCF23-201ENST00000296096 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HBBP68871 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HBBP68871 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HBBP68871 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HBBP68871 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HBBP68871 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
HBBP68871 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HBBP68871 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HBBP68871 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HBBP68871 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HBBP68871 SFMBT2-204ENST00000397167 8024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HBBP68871 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HBBP68871 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HBBP68871 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HBBP68871 STRIP2-201ENST00000249344 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HBBP68871 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HBBP68871 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HBBP68871 ITSN1-208ENST00000399349 5191 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HBBP68871 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HBBP68871 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HBBP68871 CREBZF-204ENST00000527447 4037 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HBBP68871 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HBBP68871 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
HBBP68871 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HBBP68871 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
HBBP68871 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HBBP68871 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HBBP68871 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HBBP68871 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HBBP68871 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HBBP68871 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HBBP68871 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HBBP68871 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HBBP68871 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HBBP68871 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms