Protein–RNA interactions for Protein: P61601

NCALD, Neurocalcin-delta, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCALDP61601 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NCALDP61601 CICP1-201ENST00000416803 2410 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NCALDP61601 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NCALDP61601 ZNF274-210ENST00000610905 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NCALDP61601 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NCALDP61601 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NCALDP61601 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NCALDP61601 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NCALDP61601 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NCALDP61601 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NCALDP61601 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NCALDP61601 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NCALDP61601 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NCALDP61601 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NCALDP61601 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NCALDP61601 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NCALDP61601 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NCALDP61601 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NCALDP61601 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NCALDP61601 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NCALDP61601 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NCALDP61601 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NCALDP61601 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NCALDP61601 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NCALDP61601 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NCALDP61601 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NCALDP61601 SNX12-202ENST00000374274 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NCALDP61601 TRIM26-267ENST00000453195 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NCALDP61601 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NCALDP61601 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NCALDP61601 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NCALDP61601 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NCALDP61601 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NCALDP61601 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NCALDP61601 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NCALDP61601 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NCALDP61601 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NCALDP61601 VENTXP1-201ENST00000569334 2716 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NCALDP61601 TOLLIP-203ENST00000525159 3429 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NCALDP61601 PIK3R6-204ENST00000619866 3041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NCALDP61601 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NCALDP61601 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NCALDP61601 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NCALDP61601 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NCALDP61601 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NCALDP61601 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NCALDP61601 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NCALDP61601 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NCALDP61601 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NCALDP61601 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NCALDP61601 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NCALDP61601 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NCALDP61601 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NCALDP61601 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NCALDP61601 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NCALDP61601 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NCALDP61601 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NCALDP61601 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NCALDP61601 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NCALDP61601 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NCALDP61601 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NCALDP61601 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NCALDP61601 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NCALDP61601 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NCALDP61601 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NCALDP61601 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NCALDP61601 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NCALDP61601 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NCALDP61601 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NCALDP61601 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NCALDP61601 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NCALDP61601 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NCALDP61601 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NCALDP61601 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NCALDP61601 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NCALDP61601 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NCALDP61601 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NCALDP61601 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NCALDP61601 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NCALDP61601 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NCALDP61601 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NCALDP61601 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NCALDP61601 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NCALDP61601 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NCALDP61601 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NCALDP61601 NF1-204ENST00000431387 2889 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NCALDP61601 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NCALDP61601 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NCALDP61601 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NCALDP61601 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NCALDP61601 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NCALDP61601 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NCALDP61601 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NCALDP61601 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NCALDP61601 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NCALDP61601 GUCY1B3-205ENST00000505764 2456 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NCALDP61601 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NCALDP61601 RRM2B-211ENST00000621845 3483 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NCALDP61601 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NCALDP61601 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms