Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNB3P54284 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNB3P54284 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNB3P54284 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNB3P54284 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNB3P54284 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNB3P54284 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNB3P54284 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNB3P54284 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNB3P54284 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNB3P54284 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNB3P54284 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNB3P54284 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNB3P54284 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNB3P54284 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNB3P54284 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNB3P54284 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNB3P54284 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNB3P54284 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNB3P54284 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNB3P54284 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNB3P54284 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNB3P54284 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNB3P54284 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNB3P54284 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNB3P54284 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNB3P54284 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNB3P54284 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNB3P54284 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNB3P54284 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNB3P54284 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNB3P54284 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNB3P54284 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNB3P54284 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNB3P54284 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNB3P54284 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNB3P54284 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNB3P54284 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNB3P54284 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNB3P54284 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNB3P54284 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNB3P54284 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNB3P54284 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNB3P54284 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNB3P54284 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNB3P54284 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNB3P54284 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNB3P54284 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNB3P54284 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNB3P54284 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNB3P54284 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNB3P54284 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNB3P54284 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNB3P54284 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNB3P54284 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNB3P54284 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNB3P54284 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNB3P54284 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNB3P54284 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNB3P54284 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNB3P54284 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNB3P54284 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNB3P54284 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNB3P54284 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNB3P54284 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNB3P54284 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNB3P54284 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNB3P54284 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNB3P54284 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNB3P54284 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNB3P54284 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNB3P54284 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNB3P54284 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNB3P54284 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNB3P54284 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNB3P54284 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNB3P54284 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNB3P54284 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNB3P54284 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNB3P54284 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNB3P54284 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNB3P54284 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNB3P54284 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNB3P54284 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNB3P54284 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNB3P54284 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNB3P54284 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNB3P54284 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNB3P54284 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNB3P54284 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNB3P54284 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNB3P54284 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNB3P54284 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNB3P54284 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNB3P54284 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNB3P54284 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNB3P54284 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNB3P54284 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNB3P54284 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNB3P54284 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1734.8 ms