Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP3M2P53677 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms