Protein–RNA interactions for Protein: P52888

THOP1, Thimet oligopeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THOP1P52888 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
THOP1P52888 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
THOP1P52888 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
THOP1P52888 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
THOP1P52888 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
THOP1P52888 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
THOP1P52888 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
THOP1P52888 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.06■□□□□ 0
THOP1P52888 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
THOP1P52888 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
THOP1P52888 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
THOP1P52888 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
THOP1P52888 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
THOP1P52888 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
THOP1P52888 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
THOP1P52888 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
THOP1P52888 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
THOP1P52888 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
THOP1P52888 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
THOP1P52888 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.06■□□□□ 0
THOP1P52888 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.06■□□□□ 0
THOP1P52888 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
THOP1P52888 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
THOP1P52888 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
THOP1P52888 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
THOP1P52888 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
THOP1P52888 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
THOP1P52888 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
THOP1P52888 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
THOP1P52888 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
THOP1P52888 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
THOP1P52888 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
THOP1P52888 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
THOP1P52888 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
THOP1P52888 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
THOP1P52888 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
THOP1P52888 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
THOP1P52888 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
THOP1P52888 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
THOP1P52888 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
THOP1P52888 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
THOP1P52888 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
THOP1P52888 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
THOP1P52888 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
THOP1P52888 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
THOP1P52888 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
THOP1P52888 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
THOP1P52888 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
THOP1P52888 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
THOP1P52888 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
THOP1P52888 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
THOP1P52888 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
THOP1P52888 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
THOP1P52888 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
THOP1P52888 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
THOP1P52888 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
THOP1P52888 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
THOP1P52888 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
THOP1P52888 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
THOP1P52888 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
THOP1P52888 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
THOP1P52888 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
THOP1P52888 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
THOP1P52888 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
THOP1P52888 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
THOP1P52888 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
THOP1P52888 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
THOP1P52888 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
THOP1P52888 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
THOP1P52888 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
THOP1P52888 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
THOP1P52888 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
THOP1P52888 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
THOP1P52888 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
THOP1P52888 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
THOP1P52888 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
THOP1P52888 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
THOP1P52888 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
THOP1P52888 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
THOP1P52888 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.05■□□□□ -0
THOP1P52888 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
THOP1P52888 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
THOP1P52888 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
THOP1P52888 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
THOP1P52888 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.05■□□□□ -0
THOP1P52888 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.05■□□□□ -0
THOP1P52888 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
THOP1P52888 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
THOP1P52888 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
THOP1P52888 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
THOP1P52888 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
THOP1P52888 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
THOP1P52888 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
THOP1P52888 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
THOP1P52888 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
THOP1P52888 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.04■□□□□ -0
THOP1P52888 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
THOP1P52888 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
THOP1P52888 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
THOP1P52888 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms