Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 MT1G-203ENST00000568675 628 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 AP000356.3-203ENST00000614808 601 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 TRBV5-7-201ENST00000390378 343 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 LINC02252-201ENST00000565706 487 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 PRMT1P1-201ENST00000604252 1009 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 Metazoa_SRP.200-201ENST00000622073 282 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 AC020904.3-201ENST00000624199 442 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 PRL-201ENST00000306482 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 ZNF691-201ENST00000372502 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 MT1E-202ENST00000330439 729 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 PLA2G2A-202ENST00000400520 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 KLHL7-204ENST00000410047 1233 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 LRRC3-AS1-201ENST00000426578 784 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 SOD2-205ENST00000444946 917 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 RPAIN-205ENST00000536255 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 AL359219.1-201ENST00000556311 934 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 AL451165.2-201ENST00000606971 718 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 Metazoa_SRP.83-201ENST00000611762 320 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 Metazoa_SRP.127-201ENST00000614914 302 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 Metazoa_SRP.37-201ENST00000617743 320 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 KCTD6-205ENST00000490264 1759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 AC023141.7-201ENST00000430646 407 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 SERBP1P2-201ENST00000436888 1164 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 C11orf53-201ENST00000280325 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 PROK2-201ENST00000295619 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 SUMO4-201ENST00000326669 1066 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 CTSL-202ENST00000342020 933 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 AP000244.1-201ENST00000424582 201 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 AL121787.1-202ENST00000445838 876 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 AC117945.1-201ENST00000451375 463 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 FAM3D-AS1-201ENST00000464125 821 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 CD300LF-206ENST00000464910 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 PAX5-210ENST00000520281 969 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 FBXO36P1-201ENST00000579006 471 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 RNF103-CHMP3-202ENST00000604011 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 AC073869.4-201ENST00000620841 800 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMARCA4P51532 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 S100A13-203ENST00000392623 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 BX248123.1-201ENST00000429070 606 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 CDCA4P4-201ENST00000435216 680 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 AC139099.2-201ENST00000572343 641 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 POLR2E-204ENST00000586746 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 LPCAT4-209ENST00000617710 1719 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms