Protein–RNA interactions for Protein: P45452

MMP13, Collagenase 3, humanhuman

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Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP13P45452 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP13P45452 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP13P45452 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP13P45452 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP13P45452 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP13P45452 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP13P45452 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP13P45452 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP13P45452 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP13P45452 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP13P45452 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP13P45452 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP13P45452 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP13P45452 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP13P45452 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP13P45452 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP13P45452 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP13P45452 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP13P45452 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP13P45452 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP13P45452 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP13P45452 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP13P45452 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP13P45452 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP13P45452 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP13P45452 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP13P45452 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP13P45452 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP13P45452 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP13P45452 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP13P45452 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP13P45452 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MMP13P45452 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MMP13P45452 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MMP13P45452 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MMP13P45452 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
MMP13P45452 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MMP13P45452 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MMP13P45452 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
MMP13P45452 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MMP13P45452 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP13P45452 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP13P45452 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP13P45452 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP13P45452 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP13P45452 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP13P45452 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP13P45452 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP13P45452 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP13P45452 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP13P45452 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP13P45452 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP13P45452 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP13P45452 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP13P45452 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP13P45452 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP13P45452 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP13P45452 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP13P45452 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP13P45452 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP13P45452 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP13P45452 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP13P45452 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP13P45452 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP13P45452 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP13P45452 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP13P45452 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP13P45452 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP13P45452 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP13P45452 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP13P45452 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP13P45452 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP13P45452 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP13P45452 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP13P45452 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP13P45452 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP13P45452 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP13P45452 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP13P45452 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP13P45452 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP13P45452 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP13P45452 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP13P45452 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP13P45452 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP13P45452 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP13P45452 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP13P45452 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP13P45452 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP13P45452 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP13P45452 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP13P45452 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP13P45452 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP13P45452 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP13P45452 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP13P45452 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP13P45452 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP13P45452 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP13P45452 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP13P45452 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP13P45452 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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