Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MCAMP43121 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MCAMP43121 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MCAMP43121 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MCAMP43121 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MCAMP43121 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MCAMP43121 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MCAMP43121 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MCAMP43121 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MCAMP43121 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MCAMP43121 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MCAMP43121 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MCAMP43121 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MCAMP43121 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MCAMP43121 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
MCAMP43121 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MCAMP43121 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MCAMP43121 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MCAMP43121 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MCAMP43121 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MCAMP43121 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MCAMP43121 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MCAMP43121 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MCAMP43121 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MCAMP43121 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MCAMP43121 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MCAMP43121 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MCAMP43121 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MCAMP43121 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MCAMP43121 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MCAMP43121 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MCAMP43121 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MCAMP43121 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MCAMP43121 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MCAMP43121 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MCAMP43121 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MCAMP43121 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MCAMP43121 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MCAMP43121 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MCAMP43121 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MCAMP43121 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MCAMP43121 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MCAMP43121 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MCAMP43121 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
MCAMP43121 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
MCAMP43121 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MCAMP43121 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MCAMP43121 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MCAMP43121 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MCAMP43121 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MCAMP43121 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MCAMP43121 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MCAMP43121 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MCAMP43121 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MCAMP43121 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MCAMP43121 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
MCAMP43121 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MCAMP43121 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MCAMP43121 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MCAMP43121 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MCAMP43121 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MCAMP43121 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MCAMP43121 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MCAMP43121 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MCAMP43121 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MCAMP43121 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MCAMP43121 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MCAMP43121 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
MCAMP43121 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
MCAMP43121 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
MCAMP43121 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
MCAMP43121 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MCAMP43121 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MCAMP43121 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MCAMP43121 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MCAMP43121 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MCAMP43121 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MCAMP43121 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MCAMP43121 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MCAMP43121 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MCAMP43121 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
MCAMP43121 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MCAMP43121 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MCAMP43121 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MCAMP43121 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MCAMP43121 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MCAMP43121 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MCAMP43121 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MCAMP43121 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MCAMP43121 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MCAMP43121 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MCAMP43121 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MCAMP43121 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
MCAMP43121 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MCAMP43121 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MCAMP43121 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MCAMP43121 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MCAMP43121 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MCAMP43121 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MCAMP43121 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms