Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 CNTD1-204ENST00000588408 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 C5AR1-201ENST00000355085 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 AP003969.2-201ENST00000623739 2275 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 LPO-203ENST00000421678 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 AC106818.1-201ENST00000623223 3242 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 PTPN5-203ENST00000396168 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 LEPROTL1-201ENST00000321250 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 CALD1-205ENST00000422748 2665 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 BCCIP-202ENST00000299130 2337 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 HERPUD1-204ENST00000439977 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 TRPM5-202ENST00000528453 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 INSC-207ENST00000528567 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 ZNF689-201ENST00000287461 3547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 GNPDA1-204ENST00000503794 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TGFBR1P36897 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms