Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLD1P28340 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLD1P28340 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLD1P28340 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLD1P28340 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLD1P28340 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLD1P28340 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLD1P28340 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLD1P28340 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLD1P28340 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLD1P28340 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLD1P28340 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLD1P28340 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLD1P28340 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLD1P28340 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLD1P28340 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
POLD1P28340 AQP7-202ENST00000377425 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLD1P28340 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLD1P28340 AC002127.2-201ENST00000444032 792 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLD1P28340 AC106869.1-201ENST00000448713 577 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLD1P28340 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLD1P28340 HOXC-AS3-203ENST00000514702 368 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLD1P28340 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLD1P28340 KHDRBS3-206ENST00000520981 1243 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLD1P28340 MT2A-202ENST00000561491 581 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLD1P28340 HNRNPA1P16-201ENST00000575692 955 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
POLD1P28340 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLD1P28340 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLD1P28340 RNF103-CHMP3-202ENST00000604011 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLD1P28340 CTSH-218ENST00000615999 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLD1P28340 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLD1P28340 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLD1P28340 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLD1P28340 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLD1P28340 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLD1P28340 JPT1-202ENST00000356033 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLD1P28340 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLD1P28340 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLD1P28340 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLD1P28340 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLD1P28340 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLD1P28340 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLD1P28340 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLD1P28340 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
POLD1P28340 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLD1P28340 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLD1P28340 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLD1P28340 CR382285.1-201ENST00000625012 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLD1P28340 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLD1P28340 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLD1P28340 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLD1P28340 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLD1P28340 AC092570.1-201ENST00000414446 469 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
POLD1P28340 AL512599.1-201ENST00000430724 685 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
POLD1P28340 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLD1P28340 ASS1P2-201ENST00000439895 1223 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
POLD1P28340 HIST1H2APS2-201ENST00000454426 370 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
POLD1P28340 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLD1P28340 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
POLD1P28340 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLD1P28340 FBXO36P1-201ENST00000579006 471 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
POLD1P28340 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLD1P28340 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLD1P28340 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLD1P28340 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLD1P28340 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLD1P28340 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLD1P28340 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLD1P28340 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
POLD1P28340 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
POLD1P28340 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLD1P28340 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLD1P28340 RPF1-201ENST00000370654 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLD1P28340 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLD1P28340 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLD1P28340 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLD1P28340 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLD1P28340 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLD1P28340 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLD1P28340 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLD1P28340 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLD1P28340 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLD1P28340 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLD1P28340 BCCIP-203ENST00000368759 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLD1P28340 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
POLD1P28340 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLD1P28340 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLD1P28340 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLD1P28340 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLD1P28340 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLD1P28340 PPHLN1-223ENST00000610488 1521 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLD1P28340 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLD1P28340 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLD1P28340 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLD1P28340 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLD1P28340 LINC00892-203ENST00000454385 686 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLD1P28340 ANKRD2-204ENST00000455090 1072 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLD1P28340 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLD1P28340 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLD1P28340 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms