Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

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Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRGP23470 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 VDAC2-202ENST00000313132 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 LINC01983-201ENST00000413586 574 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 FOXP4-AS1-205ENST00000454812 575 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 MED11-202ENST00000573708 802 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 AC233280.19-201ENST00000633223 136 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 MRPL35-201ENST00000254644 1061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 NDUFB6-202ENST00000366466 761 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 EXTL3-AS1-203ENST00000520023 780 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 AC009950.1-210ENST00000594622 553 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 EZH2-202ENST00000350995 2477 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 ODF3L1-201ENST00000332145 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 ATP5J-202ENST00000400087 826 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 PRAME-206ENST00000406503 740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 FAM21EP-201ENST00000417804 985 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 AL132657.1-201ENST00000432530 712 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 NRADDP-201ENST00000437305 691 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 ORMDL2-205ENST00000552672 760 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 BATF-202ENST00000555504 361 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 TYMSP2-201ENST00000589501 424 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 AL451165.2-201ENST00000606971 718 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 AC114812.1-201ENST00000421868 689 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 AC027612.2-202ENST00000445955 1199 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 HIST1H2APS2-201ENST00000454426 370 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 AC092903.1-201ENST00000466506 262 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 AC113347.2-201ENST00000512350 279 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 SMAD7-208ENST00000591805 1152 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRGP23470 MIAT_exon5_3.1-201ENST00000613656 377 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
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