Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ITGA6P23229 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms