Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FGFR3P22607 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms