Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 PSMB4-201ENST00000290541 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 AC122719.1-201ENST00000507989 559 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 AC009779.3-204ENST00000549424 367 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 PTPN20CP-201ENST00000614090 920 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 RBM4-203ENST00000398692 921 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 AL451105.2-201ENST00000413763 1234 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 RBM4-207ENST00000506523 654 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 DIO1-204ENST00000524406 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 IGHV3OR15-7-201ENST00000558565 359 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 PTOV1-AS2-203ENST00000601893 719 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 CD79B-201ENST00000006750 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 S100A2-205ENST00000487430 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 PAQR9-AS1-203ENST00000497652 516 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 NMNAT3-213ENST00000512391 794 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMNB1P20700 ZNF576-205ENST00000529930 830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms