Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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