Protein–RNA interactions for Protein: P06746

POLB, DNA polymerase beta, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLBP06746 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLBP06746 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
POLBP06746 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
POLBP06746 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLBP06746 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
POLBP06746 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
POLBP06746 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
POLBP06746 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
POLBP06746 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
POLBP06746 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
POLBP06746 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.08■□□□□ 0
POLBP06746 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLBP06746 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLBP06746 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLBP06746 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLBP06746 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
POLBP06746 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLBP06746 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLBP06746 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLBP06746 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
POLBP06746 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLBP06746 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLBP06746 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLBP06746 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLBP06746 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
POLBP06746 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLBP06746 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLBP06746 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLBP06746 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLBP06746 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
POLBP06746 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLBP06746 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
POLBP06746 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLBP06746 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLBP06746 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLBP06746 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLBP06746 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLBP06746 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.07■□□□□ 0
POLBP06746 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.07■□□□□ 0
POLBP06746 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
POLBP06746 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
POLBP06746 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.07■□□□□ 0
POLBP06746 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
POLBP06746 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.07■□□□□ 0
POLBP06746 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.07■□□□□ 0
POLBP06746 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLBP06746 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.07■□□□□ 0
POLBP06746 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
POLBP06746 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
POLBP06746 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
POLBP06746 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLBP06746 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
POLBP06746 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLBP06746 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLBP06746 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLBP06746 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLBP06746 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLBP06746 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
POLBP06746 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLBP06746 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLBP06746 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLBP06746 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLBP06746 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLBP06746 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
POLBP06746 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
POLBP06746 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
POLBP06746 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLBP06746 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
POLBP06746 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
POLBP06746 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
POLBP06746 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLBP06746 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLBP06746 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLBP06746 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLBP06746 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLBP06746 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLBP06746 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLBP06746 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLBP06746 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
POLBP06746 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLBP06746 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLBP06746 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLBP06746 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
POLBP06746 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
POLBP06746 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
POLBP06746 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLBP06746 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
POLBP06746 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.06■□□□□ 0
POLBP06746 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.06■□□□□ 0
POLBP06746 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.06■□□□□ 0
POLBP06746 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLBP06746 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.06■□□□□ 0
POLBP06746 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
POLBP06746 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
POLBP06746 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
POLBP06746 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLBP06746 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLBP06746 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLBP06746 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.06■□□□□ 0
POLBP06746 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms