Protein–RNA interactions for Protein: O95196

CSPG5, Chondroitin sulfate proteoglycan 5, humanhuman

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CSPG5O95196 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CSPG5O95196 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CSPG5O95196 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CSPG5O95196 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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CSPG5O95196 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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CSPG5O95196 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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CSPG5O95196 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSPG5O95196 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSPG5O95196 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSPG5O95196 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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CSPG5O95196 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSPG5O95196 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSPG5O95196 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSPG5O95196 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSPG5O95196 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CSPG5O95196 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSPG5O95196 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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