Protein–RNA interactions for Protein: O75386

TULP3, Tubby-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP3O75386 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TULP3O75386 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TULP3O75386 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TULP3O75386 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TULP3O75386 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TULP3O75386 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TULP3O75386 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TULP3O75386 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TULP3O75386 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TULP3O75386 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TULP3O75386 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TULP3O75386 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TULP3O75386 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TULP3O75386 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TULP3O75386 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TULP3O75386 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TULP3O75386 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TULP3O75386 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TULP3O75386 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TULP3O75386 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TULP3O75386 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TULP3O75386 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TULP3O75386 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TULP3O75386 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TULP3O75386 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TULP3O75386 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TULP3O75386 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TULP3O75386 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TULP3O75386 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TULP3O75386 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TULP3O75386 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TULP3O75386 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TULP3O75386 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TULP3O75386 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TULP3O75386 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TULP3O75386 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TULP3O75386 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TULP3O75386 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TULP3O75386 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TULP3O75386 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TULP3O75386 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TULP3O75386 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TULP3O75386 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TULP3O75386 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TULP3O75386 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TULP3O75386 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TULP3O75386 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TULP3O75386 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TULP3O75386 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TULP3O75386 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TULP3O75386 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TULP3O75386 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TULP3O75386 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TULP3O75386 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TULP3O75386 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TULP3O75386 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TULP3O75386 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TULP3O75386 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TULP3O75386 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TULP3O75386 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TULP3O75386 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TULP3O75386 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TULP3O75386 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TULP3O75386 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TULP3O75386 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TULP3O75386 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TULP3O75386 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TULP3O75386 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TULP3O75386 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TULP3O75386 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TULP3O75386 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TULP3O75386 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TULP3O75386 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TULP3O75386 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TULP3O75386 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TULP3O75386 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TULP3O75386 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TULP3O75386 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TULP3O75386 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TULP3O75386 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TULP3O75386 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TULP3O75386 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TULP3O75386 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TULP3O75386 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TULP3O75386 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TULP3O75386 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TULP3O75386 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TULP3O75386 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TULP3O75386 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TULP3O75386 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TULP3O75386 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TULP3O75386 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TULP3O75386 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TULP3O75386 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TULP3O75386 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TULP3O75386 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TULP3O75386 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TULP3O75386 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TULP3O75386 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TULP3O75386 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms