Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
HOXA3O43365 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC11.96□□□□□ -0.49
HOXA3O43365 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
HOXA3O43365 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
HOXA3O43365 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
HOXA3O43365 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
HOXA3O43365 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
HOXA3O43365 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
HOXA3O43365 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
HOXA3O43365 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
HOXA3O43365 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
HOXA3O43365 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
HOXA3O43365 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
HOXA3O43365 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC11.96□□□□□ -0.49
HOXA3O43365 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
HOXA3O43365 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
HOXA3O43365 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
HOXA3O43365 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
HOXA3O43365 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 SLC4A7-203ENST00000425128 7970 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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HOXA3O43365 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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HOXA3O43365 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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