Protein–RNA interactions for Protein: O43189

PHF1, PHD finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF1O43189 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PHF1O43189 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PHF1O43189 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PHF1O43189 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PHF1O43189 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PHF1O43189 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PHF1O43189 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PHF1O43189 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PHF1O43189 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PHF1O43189 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PHF1O43189 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PHF1O43189 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PHF1O43189 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PHF1O43189 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PHF1O43189 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PHF1O43189 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PHF1O43189 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PHF1O43189 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PHF1O43189 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PHF1O43189 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PHF1O43189 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PHF1O43189 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PHF1O43189 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PHF1O43189 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PHF1O43189 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PHF1O43189 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PHF1O43189 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PHF1O43189 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PHF1O43189 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PHF1O43189 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PHF1O43189 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PHF1O43189 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PHF1O43189 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PHF1O43189 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PHF1O43189 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PHF1O43189 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PHF1O43189 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PHF1O43189 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PHF1O43189 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PHF1O43189 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PHF1O43189 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PHF1O43189 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PHF1O43189 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PHF1O43189 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PHF1O43189 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PHF1O43189 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PHF1O43189 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PHF1O43189 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PHF1O43189 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PHF1O43189 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PHF1O43189 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PHF1O43189 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PHF1O43189 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PHF1O43189 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PHF1O43189 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PHF1O43189 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PHF1O43189 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PHF1O43189 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PHF1O43189 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PHF1O43189 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PHF1O43189 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PHF1O43189 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PHF1O43189 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PHF1O43189 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PHF1O43189 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PHF1O43189 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PHF1O43189 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PHF1O43189 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PHF1O43189 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PHF1O43189 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PHF1O43189 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PHF1O43189 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PHF1O43189 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PHF1O43189 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PHF1O43189 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PHF1O43189 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PHF1O43189 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PHF1O43189 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PHF1O43189 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PHF1O43189 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PHF1O43189 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PHF1O43189 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PHF1O43189 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PHF1O43189 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PHF1O43189 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PHF1O43189 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PHF1O43189 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PHF1O43189 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PHF1O43189 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PHF1O43189 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PHF1O43189 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PHF1O43189 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PHF1O43189 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PHF1O43189 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PHF1O43189 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PHF1O43189 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PHF1O43189 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PHF1O43189 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PHF1O43189 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PHF1O43189 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms