Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms