Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms