Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 CACNA1G-208ENST00000442258 7226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 RAPGEF1-201ENST00000372189 6085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms