Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GOLGA6L4A6NEF3 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GOLGA6L4A6NEF3 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GOLGA6L4A6NEF3 CACNA1G-230ENST00000514717 6699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GOLGA6L4A6NEF3 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GOLGA6L4A6NEF3 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GOLGA6L4A6NEF3 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GOLGA6L4A6NEF3 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GOLGA6L4A6NEF3 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GOLGA6L4A6NEF3 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GOLGA6L4A6NEF3 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GOLGA6L4A6NEF3 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GOLGA6L4A6NEF3 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GOLGA6L4A6NEF3 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GOLGA6L4A6NEF3 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GOLGA6L4A6NEF3 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GOLGA6L4A6NEF3 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GOLGA6L4A6NEF3 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GOLGA6L4A6NEF3 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GOLGA6L4A6NEF3 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GOLGA6L4A6NEF3 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GOLGA6L4A6NEF3 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GOLGA6L4A6NEF3 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GOLGA6L4A6NEF3 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GOLGA6L4A6NEF3 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GOLGA6L4A6NEF3 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GOLGA6L4A6NEF3 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GOLGA6L4A6NEF3 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GOLGA6L4A6NEF3 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GOLGA6L4A6NEF3 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GOLGA6L4A6NEF3 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GOLGA6L4A6NEF3 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GOLGA6L4A6NEF3 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GOLGA6L4A6NEF3 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GOLGA6L4A6NEF3 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GOLGA6L4A6NEF3 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GOLGA6L4A6NEF3 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GOLGA6L4A6NEF3 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GOLGA6L4A6NEF3 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GOLGA6L4A6NEF3 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GOLGA6L4A6NEF3 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GOLGA6L4A6NEF3 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GOLGA6L4A6NEF3 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GOLGA6L4A6NEF3 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GOLGA6L4A6NEF3 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GOLGA6L4A6NEF3 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GOLGA6L4A6NEF3 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GOLGA6L4A6NEF3 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GOLGA6L4A6NEF3 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GOLGA6L4A6NEF3 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GOLGA6L4A6NEF3 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GOLGA6L4A6NEF3 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GOLGA6L4A6NEF3 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GOLGA6L4A6NEF3 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GOLGA6L4A6NEF3 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GOLGA6L4A6NEF3 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GOLGA6L4A6NEF3 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GOLGA6L4A6NEF3 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GOLGA6L4A6NEF3 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GOLGA6L4A6NEF3 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GOLGA6L4A6NEF3 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GOLGA6L4A6NEF3 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GOLGA6L4A6NEF3 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GOLGA6L4A6NEF3 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GOLGA6L4A6NEF3 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GOLGA6L4A6NEF3 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GOLGA6L4A6NEF3 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GOLGA6L4A6NEF3 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GOLGA6L4A6NEF3 NAPEPLD-201ENST00000341533 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GOLGA6L4A6NEF3 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 CEP68-202ENST00000377990 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms