Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HPS5Q9UPZ3 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HPS5Q9UPZ3 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HPS5Q9UPZ3 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HPS5Q9UPZ3 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HPS5Q9UPZ3 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HPS5Q9UPZ3 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HPS5Q9UPZ3 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HPS5Q9UPZ3 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HPS5Q9UPZ3 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HPS5Q9UPZ3 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HPS5Q9UPZ3 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HPS5Q9UPZ3 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HPS5Q9UPZ3 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HPS5Q9UPZ3 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HPS5Q9UPZ3 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HPS5Q9UPZ3 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HPS5Q9UPZ3 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HPS5Q9UPZ3 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HPS5Q9UPZ3 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HPS5Q9UPZ3 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
HPS5Q9UPZ3 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HPS5Q9UPZ3 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HPS5Q9UPZ3 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HPS5Q9UPZ3 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HPS5Q9UPZ3 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HPS5Q9UPZ3 MTATP6P19-201ENST00000413797 659 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
HPS5Q9UPZ3 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HPS5Q9UPZ3 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HPS5Q9UPZ3 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HPS5Q9UPZ3 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HPS5Q9UPZ3 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HPS5Q9UPZ3 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HPS5Q9UPZ3 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
HPS5Q9UPZ3 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
HPS5Q9UPZ3 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HPS5Q9UPZ3 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
HPS5Q9UPZ3 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HPS5Q9UPZ3 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HPS5Q9UPZ3 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HPS5Q9UPZ3 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HPS5Q9UPZ3 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HPS5Q9UPZ3 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HPS5Q9UPZ3 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HPS5Q9UPZ3 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HPS5Q9UPZ3 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HPS5Q9UPZ3 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HPS5Q9UPZ3 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HPS5Q9UPZ3 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HPS5Q9UPZ3 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HPS5Q9UPZ3 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HPS5Q9UPZ3 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HPS5Q9UPZ3 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HPS5Q9UPZ3 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HPS5Q9UPZ3 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HPS5Q9UPZ3 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HPS5Q9UPZ3 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HPS5Q9UPZ3 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HPS5Q9UPZ3 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HPS5Q9UPZ3 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HPS5Q9UPZ3 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HPS5Q9UPZ3 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HPS5Q9UPZ3 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HPS5Q9UPZ3 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HPS5Q9UPZ3 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HPS5Q9UPZ3 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HPS5Q9UPZ3 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HPS5Q9UPZ3 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HPS5Q9UPZ3 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HPS5Q9UPZ3 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HPS5Q9UPZ3 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HPS5Q9UPZ3 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HPS5Q9UPZ3 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HPS5Q9UPZ3 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HPS5Q9UPZ3 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HPS5Q9UPZ3 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HPS5Q9UPZ3 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HPS5Q9UPZ3 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HPS5Q9UPZ3 AKR1B10P2-201ENST00000577332 927 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HPS5Q9UPZ3 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HPS5Q9UPZ3 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HPS5Q9UPZ3 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HPS5Q9UPZ3 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HPS5Q9UPZ3 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HPS5Q9UPZ3 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HPS5Q9UPZ3 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HPS5Q9UPZ3 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HPS5Q9UPZ3 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HPS5Q9UPZ3 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HPS5Q9UPZ3 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HPS5Q9UPZ3 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HPS5Q9UPZ3 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HPS5Q9UPZ3 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HPS5Q9UPZ3 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HPS5Q9UPZ3 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HPS5Q9UPZ3 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HPS5Q9UPZ3 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HPS5Q9UPZ3 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HPS5Q9UPZ3 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HPS5Q9UPZ3 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms