Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N2

ARHGAP28, Rho GTPase-activating protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP28Q9P2N2 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms