Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOBEC3GQ9HC16 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC3GQ9HC16 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms