Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 AL133387.2-201ENST00000422661 2222 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 NFKB1-202ENST00000394820 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 LHCGR-201ENST00000294954 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 C1orf109-201ENST00000358011 2355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 ARID4A-206ENST00000431317 5783 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 GPR161-208ENST00000537209 8256 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 NUP58-206ENST00000463407 6360 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM237B-201ENST00000637645 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 ACADM-201ENST00000370834 2172 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 TJP2-206ENST00000453658 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 BAIAP2-202ENST00000321300 2879 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 PDXK-201ENST00000291565 7366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 CEP68-201ENST00000260569 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC10.82□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC10.82□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF142-205ENST00000449707 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 DCAF6-201ENST00000312263 3186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 SHPRH-202ENST00000367503 5237 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 CNKSR3-204ENST00000479339 2023 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 PCDHGA9-201ENST00000573521 4605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNIP3-201ENST00000295225 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 ANKRD36B-201ENST00000258459 5986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 PCDHGA6-201ENST00000517434 4775 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 PHF13-201ENST00000377648 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 COL4A6-209ENST00000545689 6380 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 RGS12-201ENST00000336727 4674 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 PRKAB2-201ENST00000254101 5417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 RBM10-201ENST00000329236 3201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 NTNG1-206ENST00000370071 3149 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 AC127496.1-201ENST00000576234 3133 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 ADAMTSL2-203ENST00000393061 4270 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 PERP-201ENST00000421351 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 CSPG4P13-202ENST00000567704 4801 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 MSH2-201ENST00000233146 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 PDE5A-202ENST00000354960 7154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 CCNY-203ENST00000374704 3960 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms