Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUK0

CHCHD7, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 7, humanhuman

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Length 85 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD7Q9BUK0 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
CHCHD7Q9BUK0 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
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