Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms