Protein–RNA interactions for Protein: Q99653

CHP1, Calcineurin B homologous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHP1Q99653 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHP1Q99653 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHP1Q99653 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHP1Q99653 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHP1Q99653 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHP1Q99653 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHP1Q99653 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHP1Q99653 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHP1Q99653 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHP1Q99653 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CHP1Q99653 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHP1Q99653 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHP1Q99653 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CHP1Q99653 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHP1Q99653 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHP1Q99653 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHP1Q99653 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CHP1Q99653 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHP1Q99653 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHP1Q99653 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHP1Q99653 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CHP1Q99653 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHP1Q99653 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHP1Q99653 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHP1Q99653 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHP1Q99653 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHP1Q99653 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHP1Q99653 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHP1Q99653 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHP1Q99653 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHP1Q99653 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHP1Q99653 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHP1Q99653 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHP1Q99653 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHP1Q99653 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHP1Q99653 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHP1Q99653 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHP1Q99653 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHP1Q99653 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CHP1Q99653 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHP1Q99653 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHP1Q99653 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHP1Q99653 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHP1Q99653 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHP1Q99653 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHP1Q99653 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHP1Q99653 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHP1Q99653 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHP1Q99653 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHP1Q99653 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHP1Q99653 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHP1Q99653 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHP1Q99653 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHP1Q99653 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHP1Q99653 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHP1Q99653 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHP1Q99653 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CHP1Q99653 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CHP1Q99653 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHP1Q99653 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CHP1Q99653 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHP1Q99653 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHP1Q99653 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CHP1Q99653 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHP1Q99653 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHP1Q99653 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHP1Q99653 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHP1Q99653 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CHP1Q99653 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHP1Q99653 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHP1Q99653 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CHP1Q99653 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CHP1Q99653 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHP1Q99653 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHP1Q99653 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHP1Q99653 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHP1Q99653 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CHP1Q99653 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHP1Q99653 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHP1Q99653 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHP1Q99653 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHP1Q99653 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHP1Q99653 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHP1Q99653 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHP1Q99653 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHP1Q99653 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHP1Q99653 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHP1Q99653 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHP1Q99653 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CHP1Q99653 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHP1Q99653 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHP1Q99653 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHP1Q99653 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHP1Q99653 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHP1Q99653 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHP1Q99653 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHP1Q99653 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHP1Q99653 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHP1Q99653 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHP1Q99653 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms