Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 DDR1-225ENST00000376568 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PCNX1Q96RV3 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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