Protein–RNA interactions for Protein: Q96L92

SNX27, Sorting nexin-27, humanhuman

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Length 541 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX27Q96L92 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX27Q96L92 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX27Q96L92 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX27Q96L92 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX27Q96L92 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX27Q96L92 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX27Q96L92 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX27Q96L92 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX27Q96L92 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX27Q96L92 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX27Q96L92 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX27Q96L92 SNRPF-204ENST00000552085 815 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX27Q96L92 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX27Q96L92 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX27Q96L92 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX27Q96L92 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX27Q96L92 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX27Q96L92 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX27Q96L92 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX27Q96L92 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX27Q96L92 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX27Q96L92 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX27Q96L92 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX27Q96L92 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX27Q96L92 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX27Q96L92 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX27Q96L92 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX27Q96L92 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX27Q96L92 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX27Q96L92 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX27Q96L92 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX27Q96L92 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX27Q96L92 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX27Q96L92 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX27Q96L92 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX27Q96L92 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX27Q96L92 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX27Q96L92 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX27Q96L92 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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SNX27Q96L92 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX27Q96L92 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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SNX27Q96L92 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX27Q96L92 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX27Q96L92 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX27Q96L92 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX27Q96L92 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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SNX27Q96L92 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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SNX27Q96L92 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX27Q96L92 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX27Q96L92 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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SNX27Q96L92 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX27Q96L92 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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SNX27Q96L92 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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SNX27Q96L92 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX27Q96L92 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX27Q96L92 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX27Q96L92 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX27Q96L92 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX27Q96L92 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX27Q96L92 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX27Q96L92 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX27Q96L92 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX27Q96L92 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX27Q96L92 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX27Q96L92 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX27Q96L92 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX27Q96L92 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX27Q96L92 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX27Q96L92 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX27Q96L92 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX27Q96L92 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX27Q96L92 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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