Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP1

CHFR, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, humanhuman

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHFRQ96EP1 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHFRQ96EP1 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CHFRQ96EP1 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CHFRQ96EP1 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CHFRQ96EP1 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
CHFRQ96EP1 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CHFRQ96EP1 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CHFRQ96EP1 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CHFRQ96EP1 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CHFRQ96EP1 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CHFRQ96EP1 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
CHFRQ96EP1 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CHFRQ96EP1 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CHFRQ96EP1 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CHFRQ96EP1 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CHFRQ96EP1 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CHFRQ96EP1 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CHFRQ96EP1 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHFRQ96EP1 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHFRQ96EP1 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHFRQ96EP1 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHFRQ96EP1 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHFRQ96EP1 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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CHFRQ96EP1 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHFRQ96EP1 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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CHFRQ96EP1 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHFRQ96EP1 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHFRQ96EP1 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CHFRQ96EP1 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHFRQ96EP1 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHFRQ96EP1 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHFRQ96EP1 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHFRQ96EP1 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHFRQ96EP1 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHFRQ96EP1 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHFRQ96EP1 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHFRQ96EP1 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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CHFRQ96EP1 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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CHFRQ96EP1 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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CHFRQ96EP1 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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CHFRQ96EP1 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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CHFRQ96EP1 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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CHFRQ96EP1 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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CHFRQ96EP1 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CHFRQ96EP1 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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CHFRQ96EP1 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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CHFRQ96EP1 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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CHFRQ96EP1 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CHFRQ96EP1 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CHFRQ96EP1 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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CHFRQ96EP1 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CHFRQ96EP1 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CHFRQ96EP1 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CHFRQ96EP1 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
CHFRQ96EP1 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CHFRQ96EP1 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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