Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SIRT1Q96EB6 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SIRT1Q96EB6 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SIRT1Q96EB6 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SIRT1Q96EB6 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SIRT1Q96EB6 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SIRT1Q96EB6 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SIRT1Q96EB6 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SIRT1Q96EB6 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SIRT1Q96EB6 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SIRT1Q96EB6 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SIRT1Q96EB6 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SIRT1Q96EB6 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SIRT1Q96EB6 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SIRT1Q96EB6 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SIRT1Q96EB6 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SIRT1Q96EB6 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SIRT1Q96EB6 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SIRT1Q96EB6 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SIRT1Q96EB6 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SIRT1Q96EB6 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SIRT1Q96EB6 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SIRT1Q96EB6 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SIRT1Q96EB6 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SIRT1Q96EB6 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SIRT1Q96EB6 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SIRT1Q96EB6 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms