Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC9

OTUB2, Ubiquitin thioesterase OTUB2, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUB2Q96DC9 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
OTUB2Q96DC9 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OTUB2Q96DC9 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
OTUB2Q96DC9 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OTUB2Q96DC9 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OTUB2Q96DC9 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OTUB2Q96DC9 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OTUB2Q96DC9 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OTUB2Q96DC9 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
OTUB2Q96DC9 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OTUB2Q96DC9 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OTUB2Q96DC9 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OTUB2Q96DC9 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
OTUB2Q96DC9 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
OTUB2Q96DC9 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OTUB2Q96DC9 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OTUB2Q96DC9 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OTUB2Q96DC9 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OTUB2Q96DC9 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OTUB2Q96DC9 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
OTUB2Q96DC9 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC15.04■□□□□ -0
OTUB2Q96DC9 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
OTUB2Q96DC9 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
OTUB2Q96DC9 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
OTUB2Q96DC9 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
OTUB2Q96DC9 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC15.04■□□□□ -0
OTUB2Q96DC9 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
OTUB2Q96DC9 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
OTUB2Q96DC9 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OTUB2Q96DC9 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
OTUB2Q96DC9 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OTUB2Q96DC9 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OTUB2Q96DC9 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OTUB2Q96DC9 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OTUB2Q96DC9 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OTUB2Q96DC9 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
OTUB2Q96DC9 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OTUB2Q96DC9 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OTUB2Q96DC9 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
OTUB2Q96DC9 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
OTUB2Q96DC9 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
OTUB2Q96DC9 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OTUB2Q96DC9 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OTUB2Q96DC9 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OTUB2Q96DC9 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OTUB2Q96DC9 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
OTUB2Q96DC9 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OTUB2Q96DC9 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
OTUB2Q96DC9 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OTUB2Q96DC9 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
OTUB2Q96DC9 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
OTUB2Q96DC9 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
OTUB2Q96DC9 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
OTUB2Q96DC9 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OTUB2Q96DC9 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OTUB2Q96DC9 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OTUB2Q96DC9 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OTUB2Q96DC9 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OTUB2Q96DC9 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OTUB2Q96DC9 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
OTUB2Q96DC9 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
OTUB2Q96DC9 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
OTUB2Q96DC9 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
OTUB2Q96DC9 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
OTUB2Q96DC9 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
OTUB2Q96DC9 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OTUB2Q96DC9 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OTUB2Q96DC9 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OTUB2Q96DC9 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
OTUB2Q96DC9 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OTUB2Q96DC9 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
OTUB2Q96DC9 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
OTUB2Q96DC9 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OTUB2Q96DC9 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OTUB2Q96DC9 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC15.03■□□□□ -0
OTUB2Q96DC9 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OTUB2Q96DC9 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
OTUB2Q96DC9 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OTUB2Q96DC9 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
OTUB2Q96DC9 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC15.03■□□□□ -0
OTUB2Q96DC9 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
OTUB2Q96DC9 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.03■□□□□ -0
OTUB2Q96DC9 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OTUB2Q96DC9 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC15.03■□□□□ -0
OTUB2Q96DC9 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OTUB2Q96DC9 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.03■□□□□ -0
OTUB2Q96DC9 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.03■□□□□ -0
OTUB2Q96DC9 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OTUB2Q96DC9 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
OTUB2Q96DC9 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OTUB2Q96DC9 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OTUB2Q96DC9 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OTUB2Q96DC9 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OTUB2Q96DC9 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OTUB2Q96DC9 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OTUB2Q96DC9 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
OTUB2Q96DC9 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
OTUB2Q96DC9 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
OTUB2Q96DC9 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
OTUB2Q96DC9 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 221.9 ms