Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

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Length 71 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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SPTSSAQ969W0 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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