Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN4Q92575 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms