Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 MCRIP1-212ENST00000576730 2979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 INTS3-204ENST00000435409 3597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 MAD1L1-201ENST00000265854 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 TMEM229B-207ENST00000557006 3941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 PRPSAP1-206ENST00000446526 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 MEP1A-201ENST00000230588 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 RRBP1-206ENST00000455029 2485 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 AP003969.2-201ENST00000623739 2275 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 ZBTB42-201ENST00000342537 3800 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 CTDP1-202ENST00000299543 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 PRPF4-201ENST00000374198 2787 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 PLEKHG3-203ENST00000471182 3106 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 GLB1L-201ENST00000295759 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 KLF7-204ENST00000423015 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 TMEM233-201ENST00000426426 3081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 DYNC1I1-201ENST00000324972 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 METAP1-201ENST00000296411 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 NSF-201ENST00000398238 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 NCS1-201ENST00000372398 4991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 AC010970.1-201ENST00000445125 1848 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 ANKRD20A1-201ENST00000562196 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 AL390066.1-201ENST00000456414 2302 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 PACSIN2-202ENST00000337959 3149 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 SLC26A6-205ENST00000395550 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 MYO1G-201ENST00000258787 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 DGKA-202ENST00000394147 2770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 C2-209ENST00000452323 1999 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 TYK2-205ENST00000525621 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 C10orf90-202ENST00000356858 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 MAMDC4-201ENST00000317446 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MYRIPQ8NFW9 CDK5RAP1-203ENST00000357886 2164 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms