Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Y2

LRRC17, Leucine-rich repeat-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC17Q8N6Y2 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRC17Q8N6Y2 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRC17Q8N6Y2 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRC17Q8N6Y2 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRC17Q8N6Y2 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRC17Q8N6Y2 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRC17Q8N6Y2 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRC17Q8N6Y2 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRC17Q8N6Y2 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRC17Q8N6Y2 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRC17Q8N6Y2 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRC17Q8N6Y2 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRC17Q8N6Y2 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRC17Q8N6Y2 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRC17Q8N6Y2 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRC17Q8N6Y2 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRC17Q8N6Y2 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRC17Q8N6Y2 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRC17Q8N6Y2 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRC17Q8N6Y2 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRC17Q8N6Y2 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRC17Q8N6Y2 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRC17Q8N6Y2 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRC17Q8N6Y2 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRC17Q8N6Y2 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRC17Q8N6Y2 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRC17Q8N6Y2 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRC17Q8N6Y2 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRC17Q8N6Y2 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRC17Q8N6Y2 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRC17Q8N6Y2 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRC17Q8N6Y2 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRC17Q8N6Y2 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRC17Q8N6Y2 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRC17Q8N6Y2 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRC17Q8N6Y2 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRC17Q8N6Y2 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRC17Q8N6Y2 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRC17Q8N6Y2 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRC17Q8N6Y2 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRC17Q8N6Y2 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRC17Q8N6Y2 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRC17Q8N6Y2 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LRRC17Q8N6Y2 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LRRC17Q8N6Y2 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LRRC17Q8N6Y2 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LRRC17Q8N6Y2 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
LRRC17Q8N6Y2 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LRRC17Q8N6Y2 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LRRC17Q8N6Y2 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LRRC17Q8N6Y2 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LRRC17Q8N6Y2 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LRRC17Q8N6Y2 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LRRC17Q8N6Y2 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LRRC17Q8N6Y2 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LRRC17Q8N6Y2 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LRRC17Q8N6Y2 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LRRC17Q8N6Y2 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LRRC17Q8N6Y2 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LRRC17Q8N6Y2 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LRRC17Q8N6Y2 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LRRC17Q8N6Y2 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LRRC17Q8N6Y2 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LRRC17Q8N6Y2 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LRRC17Q8N6Y2 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
LRRC17Q8N6Y2 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LRRC17Q8N6Y2 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LRRC17Q8N6Y2 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LRRC17Q8N6Y2 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LRRC17Q8N6Y2 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LRRC17Q8N6Y2 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LRRC17Q8N6Y2 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LRRC17Q8N6Y2 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LRRC17Q8N6Y2 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LRRC17Q8N6Y2 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LRRC17Q8N6Y2 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LRRC17Q8N6Y2 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LRRC17Q8N6Y2 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LRRC17Q8N6Y2 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LRRC17Q8N6Y2 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LRRC17Q8N6Y2 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LRRC17Q8N6Y2 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LRRC17Q8N6Y2 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LRRC17Q8N6Y2 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LRRC17Q8N6Y2 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LRRC17Q8N6Y2 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LRRC17Q8N6Y2 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
LRRC17Q8N6Y2 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LRRC17Q8N6Y2 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LRRC17Q8N6Y2 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LRRC17Q8N6Y2 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LRRC17Q8N6Y2 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LRRC17Q8N6Y2 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LRRC17Q8N6Y2 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LRRC17Q8N6Y2 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LRRC17Q8N6Y2 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
LRRC17Q8N6Y2 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LRRC17Q8N6Y2 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LRRC17Q8N6Y2 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LRRC17Q8N6Y2 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81 ms