Protein–RNA interactions for Protein: Q7L0J3

SV2A, Synaptic vesicle glycoprotein 2A, humanhuman

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Length 742 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2AQ7L0J3 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SV2AQ7L0J3 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SV2AQ7L0J3 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SV2AQ7L0J3 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SV2AQ7L0J3 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SV2AQ7L0J3 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SV2AQ7L0J3 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SV2AQ7L0J3 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SV2AQ7L0J3 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SV2AQ7L0J3 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SV2AQ7L0J3 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SV2AQ7L0J3 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SV2AQ7L0J3 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SV2AQ7L0J3 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SV2AQ7L0J3 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SV2AQ7L0J3 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SV2AQ7L0J3 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SV2AQ7L0J3 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SV2AQ7L0J3 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SV2AQ7L0J3 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SV2AQ7L0J3 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SV2AQ7L0J3 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SV2AQ7L0J3 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SV2AQ7L0J3 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SV2AQ7L0J3 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SV2AQ7L0J3 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SV2AQ7L0J3 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SV2AQ7L0J3 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SV2AQ7L0J3 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SV2AQ7L0J3 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SV2AQ7L0J3 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SV2AQ7L0J3 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SV2AQ7L0J3 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SV2AQ7L0J3 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SV2AQ7L0J3 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SV2AQ7L0J3 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SV2AQ7L0J3 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SV2AQ7L0J3 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SV2AQ7L0J3 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SV2AQ7L0J3 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SV2AQ7L0J3 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SV2AQ7L0J3 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SV2AQ7L0J3 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SV2AQ7L0J3 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SV2AQ7L0J3 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SV2AQ7L0J3 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SV2AQ7L0J3 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SV2AQ7L0J3 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SV2AQ7L0J3 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SV2AQ7L0J3 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SV2AQ7L0J3 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SV2AQ7L0J3 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SV2AQ7L0J3 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SV2AQ7L0J3 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SV2AQ7L0J3 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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SV2AQ7L0J3 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SV2AQ7L0J3 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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SV2AQ7L0J3 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SV2AQ7L0J3 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SV2AQ7L0J3 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SV2AQ7L0J3 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SV2AQ7L0J3 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SV2AQ7L0J3 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SV2AQ7L0J3 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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SV2AQ7L0J3 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SV2AQ7L0J3 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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SV2AQ7L0J3 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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SV2AQ7L0J3 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SV2AQ7L0J3 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SV2AQ7L0J3 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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SV2AQ7L0J3 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SV2AQ7L0J3 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SV2AQ7L0J3 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SV2AQ7L0J3 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SV2AQ7L0J3 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SV2AQ7L0J3 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SV2AQ7L0J3 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SV2AQ7L0J3 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SV2AQ7L0J3 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SV2AQ7L0J3 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SV2AQ7L0J3 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SV2AQ7L0J3 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SV2AQ7L0J3 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SV2AQ7L0J3 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SV2AQ7L0J3 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SV2AQ7L0J3 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SV2AQ7L0J3 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SV2AQ7L0J3 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SV2AQ7L0J3 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SV2AQ7L0J3 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SV2AQ7L0J3 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms