Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC01545Q5VT33 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC01545Q5VT33 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC01545Q5VT33 TNRC18P1-201ENST00000502875 3650 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC01545Q5VT33 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC01545Q5VT33 HINT3-201ENST00000229633 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC01545Q5VT33 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC01545Q5VT33 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC01545Q5VT33 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC01545Q5VT33 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC01545Q5VT33 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC01545Q5VT33 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC01545Q5VT33 DNAJB8-201ENST00000319153 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
LINC01545Q5VT33 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
LINC01545Q5VT33 DRD2-210ENST00000544518 2473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
LINC01545Q5VT33 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
LINC01545Q5VT33 KIAA1217-209ENST00000430453 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
LINC01545Q5VT33 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
LINC01545Q5VT33 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
LINC01545Q5VT33 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
LINC01545Q5VT33 ARMC7-201ENST00000245543 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
LINC01545Q5VT33 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
LINC01545Q5VT33 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
LINC01545Q5VT33 SAP30BP-225ENST00000584667 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
LINC01545Q5VT33 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
LINC01545Q5VT33 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
LINC01545Q5VT33 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 BUB1B-PAK6-201ENST00000441369 2767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 LINC02188-202ENST00000569740 3775 ntTSL 4 BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
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LINC01545Q5VT33 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 TP53INP1-202ENST00000448464 5631 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 AP003969.2-201ENST00000623739 2275 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 CYB5A-202ENST00000340533 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 MICAL1-208ENST00000630715 3678 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
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LINC01545Q5VT33 PCDHGB3-201ENST00000576222 4727 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 C1orf167-202ENST00000433342 4545 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
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LINC01545Q5VT33 HERPUD1-204ENST00000439977 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 GCOM1-214ENST00000587652 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
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LINC01545Q5VT33 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 ATXN2L-225ENST00000570200 3635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 NLRP2-204ENST00000391721 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 HERC3-203ENST00000407637 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 AGAP5-202ENST00000443782 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 AGAP4-203ENST00000448048 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 PCDHB17P-202ENST00000623466 3066 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 DGKZ-216ENST00000528615 2692 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 INCENP-202ENST00000394818 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 CDK2-201ENST00000266970 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 AL445250.1-201ENST00000641671 2259 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 DCAF12L1-201ENST00000371126 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 CYP2J2-201ENST00000371204 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 ST5-256ENST00000534127 4545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 ZBED2-201ENST00000317012 2311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 AKAP13-201ENST00000361243 9468 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LINC01545Q5VT33 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
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