Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms