Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 LPCAT2-201ENST00000262134 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 PAX7-203ENST00000420770 5538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC11.22□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC11.22□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC11.22□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.22□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 GPR161-209ENST00000539777 7655 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 TECTA-201ENST00000264037 6468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 FAM193A-201ENST00000324666 4846 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 MRVI1-201ENST00000423302 6126 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 CIPC-201ENST00000361786 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 CYB5RL-201ENST00000287899 5777 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 LINC00865-202ENST00000448963 4272 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 NUMA1-234ENST00000620566 7012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 BCORL1-201ENST00000218147 6860 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 AL805961.2-201ENST00000642139 4817 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
RRN3P1Q2M238 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.4 ms