Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
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SSX1Q16384 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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SSX1Q16384 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
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SSX1Q16384 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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SSX1Q16384 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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SSX1Q16384 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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SSX1Q16384 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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SSX1Q16384 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC13.16□□□□□ -0.3
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SSX1Q16384 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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