Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SEC23BQ15437 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms