Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB35Q15286 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB35Q15286 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB35Q15286 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB35Q15286 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB35Q15286 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB35Q15286 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB35Q15286 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB35Q15286 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB35Q15286 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB35Q15286 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB35Q15286 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB35Q15286 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB35Q15286 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB35Q15286 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB35Q15286 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB35Q15286 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB35Q15286 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB35Q15286 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB35Q15286 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB35Q15286 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB35Q15286 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB35Q15286 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB35Q15286 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB35Q15286 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB35Q15286 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB35Q15286 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB35Q15286 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB35Q15286 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB35Q15286 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB35Q15286 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB35Q15286 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB35Q15286 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB35Q15286 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB35Q15286 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB35Q15286 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB35Q15286 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB35Q15286 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB35Q15286 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB35Q15286 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB35Q15286 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB35Q15286 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB35Q15286 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB35Q15286 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB35Q15286 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB35Q15286 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB35Q15286 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB35Q15286 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB35Q15286 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB35Q15286 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB35Q15286 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB35Q15286 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB35Q15286 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB35Q15286 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB35Q15286 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB35Q15286 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB35Q15286 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB35Q15286 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB35Q15286 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB35Q15286 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
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RAB35Q15286 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB35Q15286 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB35Q15286 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB35Q15286 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB35Q15286 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
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RAB35Q15286 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB35Q15286 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB35Q15286 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB35Q15286 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
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RAB35Q15286 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB35Q15286 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB35Q15286 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB35Q15286 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB35Q15286 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB35Q15286 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB35Q15286 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB35Q15286 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB35Q15286 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB35Q15286 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB35Q15286 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB35Q15286 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB35Q15286 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB35Q15286 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB35Q15286 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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