Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms